В 1965 году Морриконе присоединился к группе импровизации Nuova Consonanza. С 1960 года Морриконе написал музыку более чем к 450 фильмам, работая с многими итальянскими и международными режиссерами, включая Серджио Леоне, Джилло Понтекорво, Пьера Паоло Пазолини, Бернардо Бертолуччи, Джулиано Монтальдо, Лину Вертмюллер, Джузеппе Торнаторе, Брайана Де Пальму, Романа Полански, Уоррена Битти, Эдриана Лайна, Оливера Стоуна, Маргарете фон Тротта, Анри Вернея, Педро Альмодовара и Роланда Жоффе. Его самые известные фильмы (помимо итальянских вестернов) включают: The Battle of Algiers; Sacco and Vanzetti; Cinema Paradiso; The Legend of 1900, Malena; The Untouchables; Once Upon a Time in America; The Mission и U-Turn. Его абсолютная музыкальная продукция включает более 100 произведений, написанных с 1946 года до настоящего времени. Названия включают Concerto per Orchestra n.1 (1957); Frammenti di Eros (1985); Cantata per L’Europa (1988); UT, per tromba, archi e percussioni (1991); Ombra di lontana presenza (1997); Voci dal silenzio (2002); Sicilo ed altri frammenti (2007); Vuoto d’anima piena (2008). В 2001 году Эннио Морриконе начал период интенсивной концертной деятельности, дирижируя своей киномузыкой и концертными произведениями для симфонического оркестра и полифонического хора более чем в 100 концертах по всей Европе, Азии, США, Центральной и Южной Америке.
За свою долгую карьеру Эннио Морриконе также получил множество наград. Помимо Золотого льва и почетного Оскара, который он получил в 2003 году, ему были вручены восемь Nastri D’argento, пять BAFTA, пять номинаций на Оскар, семь David Di Donatello, три Золотых глобуса, одна премия Грэмми и одна Европейская кинопремия. В 2009 году тогдашний президент Французской Республики Николя Саркози также подписал указ о назначении Морриконе в ранг Кавалера Ордена Почетного легиона.
В области звукозаписи Морриконе получил 27 золотых дисков, семь платиновых дисков, три Золотые пластины и премию Critica discografica за музыку к фильму Il Prato. Саундтрек к фильму The Good, The Bad and The Ugly был включен в Зал славы Грэмми в 2009 году, а сам Морриконе был удостоен престижной премии Polar Music в следующем году.
Его более поздние работы включают музыку к телевизионным сериалам Karol and The End of a Mystery, 72 Meters и Fateless. В 21 веке музыка Морриконе многократно использовалась для телевидения и в кино, включая фильмы Квентина Тарантино Kill Bill (2003), Death Proof (2007), Inglourious Basterds (2009) и Django Unchained (2012). В 2007 году Морриконе получил Почетную премию Академии «за его великолепный и многогранный вклад в искусство киномузыки».
В ноябре 2013 года он начал мировое турне, приуроченное к 50-летию его карьеры в киномузыке, и выступал в таких местах, как Crocus City Hall в Москве, Сантьяго, Чили, Берлин, Германия (O2 World), Будапешт, Венгрия, и Stadhalle в Вене. 6 февраля 2014 года Риккардо Мути дирижировал Чикагским симфоническим оркестром, исполняя Voices from the Silence Морриконе, кантату, которую Морриконе написал в ответ на события 11 сентября, чтобы дать голос невинным жертвам. Осенью 2014 года Морриконе участвовал в записи документального фильма о себе, снятого Джузеппе Торнаторе, который еще не был выпущен.
Его европейское турне возобновилось с февраля 2015 года по март 2015 года, с 20 концертами в 12 странах, в крупнейших аренах Европы, таких как O2 в Лондоне и Ziggo Dome в Амстердаме. Выступая перед общей аудиторией в 150 000 зрителей и с большинством распроданных шоу, европейское арена-турне Маэстро Морриконе «Моя жизнь в музыке» стало оглушительным успехом.
12 июня 2015 года Морриконе дирижировал мессой, посвященной Папе Франциску. Она была заказана Орденом иезуитов в честь 200-летия воссоединения Ордена иезуитов в церкви иезуитов в Риме.
2015 год также ознаменовался сотрудничеством Морриконе с Квентином Тарантино над оригинальным саундтреком впервые. 7 декабря 2015 года состоялась мировая премьера фильма The Hateful Eight, за которой на следующий день последовала номинация на Золотой глобус в категории «Лучший оригинальный саундтрек».
