Он дирижировал многими инструментальными и вокальными произведениями - симфониями, концертами, мессами, кантатами, ораториями и т.д. - с участием таких солистов, как Сандрине Пьо, Вероника Кангеми, Маттиас Гёрне, Филипп Жарусски, Мари-Николь Лемьё, Натали Штутцман, Дженнифер Лармор, Сара Мингардо, Марьяна Миянович. Его записи завоевали несколько международных премий, включая Diapason d'Or, Choc de l'année du Monde de la Musique, Premiointernazionale del disco Antonio Vivaldi в Венеции, Grand Prix de l'Académie Charles Cros, Prix Caecilia в Бельгии, Victoire de la Musique Classique и BBC Music Magazine Award за 2006 год.
Он выступал как солист и дирижер со своим ансамблем на крупных фестивалях и площадках во Франции (Театр Елисейских полей, Театр Шатле, Опера де Пари, Гран Интерпрет в Тулузе, Фестиваль в Амброне, Фестиваль старого Лиона) и за рубежом, в крупных культурных городах Европы (Концертгебау, Концертхаус в Берлине, в Вене, Опера де Мадрид, Дворец изящных искусств в Брюсселе и т.д.), а также по всему миру (дебют в Карнеги-холле, Нью-Йорк, февраль 08).
После дирижирования Волшебной флейтой в Опере Пармы в феврале 2006 года, он исполнил Реквием Глюка с Ансамблем Матеус в Театре Елисейских полей, за которым последовала новая постановка Волшебной флейты в Бильбао (режиссура: Д. Аббадо), а также открытие сезона 2007/08 в престижном Театро Реджио да Парма, Италия. Ансамбль Матеус имеет постоянную резиденцию в Театре Шатле, где они исполнили La Pietra del paragone Россини (режиссура: Г. Корсетти / П. Соррин) и Веро́ника Мессажера. Другие недавние выступления включают Орландо Фуриозо Вивальди с Шотландским камерным оркестром на открытии Эдинбургского международного фестиваля; Альчина Генделя в Национальной опере Парижа, тур и запись La Fida Ninfa Вивальди с Ансамблем Матеус и Волшебная флейта с Венским симфоническим оркестром в Театре ан дер Вин.
В сезоне 2008/2009 Спиноси дирижировал Так поступают все в Театре Елисейских полей и в Филармонии ам Гастайг в Мюнхене; сценической версией Вечерни Монтеверди в Театре Шатле; и сценической версией Мессии Генделя в Театре ан дер Вин и в Опере Нанси. Его концертные выступления с Ансамблем Матеус включают выступления с Филиппом Жарусски, Сьюзан Грэм, Вивикой Жено, Майклом Маниаччи и Эммануэлем Паю. Спиноси также дирижировал Национальным оркестром Капитолия Тулузы и Национальным филармоническим оркестром России, оба в концерте с Дженнифер Лармор, и Филармоническим оркестром Монте-Карло с пианистом Давидом Фреем.
Жан-Кристоф Спиноси был назначен кавалером Ордена искусств и литературы министром культуры Франции в 2006 году. Он также был удостоен звания «Лучший оперный дирижер 2007 года» Академией лирического диска.
