После работы с многочисленными известными солистами в качестве исполнителя континуо, она вскоре стала востребованной на международной арене как приглашенный дирижер. В 2001 году она добилась заметного успеха с оперой Генделя "Роделинда", а затем "Феодора" для Glyndebourne Touring Opera. С тех пор она регулярно выступает на фестивале в Глайндборне, представляя "Юлий Цезарь" Генделя в 2006 году и "Коронацию Поппеи" Монтеверди в 2008 году. Она также дирижировала Симфоническим оркестром города Бирмингема (CBSO), Шотландским камерным оркестром, Немецким симфоническим оркестром Берлина и Симфоническим оркестром Франкфуртского радио (оркестр Гессенского радио). В марте 2008 года она дебютировала с Берлинским филармоническим оркестром.
В 2000 году Эммануэль Аим собрала группу талантливых певцов и инструменталистов, которых объединяет схожий музыкальный темперамент и выразительный и естественный стилистический подход. С ними она создала свой собственный ансамбль, Le Concert d'Astrée, с которым она быстро добилась успеха как во французском барочном репертуаре (Рамо, Люлли), так и в произведениях Монтеверди, Пёрселла, Генделя и Моцарта, давая выступления от Парижа до Нью-Йорка и на фестивалях как во Франции, так и за рубежом. В 2003 году он был назван лучшим ансамблем года на Victoires de la Musique Classique.
Le Concert d'Astrée стал ансамблем-резидентом в Лилльской опере в 2004 году, представляя постановки каждый год, начиная с "Тамерлан" Генделя. Ансамбль также давал концерты в Лилле и других городах французских провинций (Национальная опера Рейна, Театр в Кане, Бордоская опера, Театр Капитолия в Тулузе), а также в Париже в Театре Шатле и Театре Елисейских полей, и за рубежом в Концертгебау в Амстердаме, Барбикан-центре в Лондоне, Линкольн-центре в Нью-Йорке, Концертхаусе в Вене и на Потсдамском фестивале и др.
Эммануэль Аим сотрудничала с режиссерами, такими как Жан-Франсуа Сивадье, Роберт Карсен, Роберт Уилсон, Дэвид Маквикар, Сандрине Англад, Стюарт Сейд, Джорджио Барберио Корсетти и, совсем недавно, Лоран Пелли в постановке "Юлий Цезарь" Генделя в Пале Гарнье в Париже в начале 2011 года. С 2001 года Эммануэль Аим и Le Concert d'Astrée записываются исключительно для Virgin Classics. Их диски неизменно получают похвалу от критиков и многочисленные награды, включая номинации на премию Грэмми как за "Дидона и Эней" Пёрселла, так и за "Орфей" Монтеверди, а также награды от Victoires de la Musique Classique за "Lamenti" в 2009 году и за диск с Филиппом Жарусски, "Карестини, История кастрата" в 2008 году.
Эммануэль Аим стала кавалером Ордена Почетного легиона в 2009 году и является кавалером Ордена искусств и литературы. Она является почетным членом Королевской академии музыки в Лондоне.
