처음부터 그리스 국립 오페라의 레퍼토리는 오페라, 오페레타, 발레로 구성되었습니다. 단체는 오페레타 Die Fledermaus로 개막되었고, 이어서 자코모 푸치니의 Madama Butterfly가 공연되었습니다. 마리아 칼로게로풀루(칼라스)는 이 단체에서 데뷔하여 자코모 푸치니의 Tosca, 루트비히 판 베토벤의 Fidelio, 유젠 드알베르트의 Tiefland, 마놀리스 칼로미리스의 The Masterbuilder와 같은 오페라에서 주역을 맡았습니다.
1944년, 독일 점령에서 해방되기 전, 단체는 국립 극장에서 분리되어 그리스 국립 오페라라는 이름으로 독립적인 길을 걷기 시작했습니다. 단체는 아카데미아 거리의 구 올림피아 극장에 자리 잡았습니다. 첫 작품은 그리스 작곡가 스피리돈-필리스코스 사마라스의 오페라 Rhea였습니다. 단체의 초대 감독은 작곡가 마놀리스 칼로미리스였습니다.
1958년 새로 지어진 올림피아 극장은 베르디의 Aida로 개관되었습니다. 이후 몇 년 동안 단체의 레퍼토리는 크게 확장되었으며, 오늘날의 문화 경영 개념에 부합하는 철학에 따라 교육적 임무에 중점을 두었습니다. 각 예술 시즌마다 약 20개의 작품이 공연되었고, 총 약 30개의 작품이 그리스 초연을 맞았습니다. 레퍼토리는 바로크부터 현대 작품에 이르기까지 모든 시대를 아우르며, 이탈리아, 프랑스, 독일 학교에서부터 동유럽의 민족 학교와 그리스 작곡가들의 작품까지 포함했습니다. 중요한 공연들은 헤로데스 아티쿠스의 오데온과 에피다우로스 고대 극장에서 마리아 칼라스가 주연을 맡아 무대에 올랐습니다.
이러한 유망한 예술적 발전은 1967년 군사 정권에 의해 중단되었습니다. 쿠데타 이후 7년 동안 그리스 국립 오페라는 테살로니키에서 정기적인 연간 월간 시즌을 도입하여 거의 모든 예술 시즌 작품을 선보였습니다. 1974년 민주주의 복원 이후, 새로운 세대의 그리스 예술가들이 극장에 초대되어 새로운 활력을 불어넣었습니다. 정치적 전환의 어려운 시기에도 훌륭한 감독들이 GNO를 이끌며 재정적 및 제도적 도전에도 불구하고 발전과 예술적 성장을 지원하고 보장했습니다. 1994년 GNO를 사법인으로 전환한 것은 발전을 더욱 촉진시켰습니다. 2000년대부터는 해외 주요 오페라 하우스와의 공동 제작 정책이 점차 발전하고 번창하기 시작했습니다. 레퍼토리의 상당한 확장에 이어 오페라 공연의 시각적 업그레이드와 조직의 국제적 홍보가 이루어졌습니다. 동시에 전국 각지에서의 아웃리치 행사를 통한 외향성 정책은 관객 확대를 이끌었습니다.
2017년 2월 23일, 그리스 국립 오페라의 새 거점인 스타브로스 니아르코스 재단 문화 센터가 그리스 정부에 인도되었습니다. 단체는 2017년 봄 시범 기간 동안 스타브로스 니아르코스 홀과 대체 무대 두 곳에서 첫 공연을 선보였습니다.