2001년에는 우즈베키스탄 국립 심포니 오케스트라의 부지휘자로 임명되었고, 2006년에는 수석 지휘자가 되었다.
2010년, 그의 경력은 밤베르크에서 열린 권위 있는 국제 구스타프 말러 지휘 콩쿠르에서 2등상을 수상하며 새로운 전환점을 맞았다. 이 상은 그가 슈타츠카펠레 드레스덴, 런던 필하모닉 오케스트라, 루체른 심포니 오케스트라, 밀라노 주세페 베르디 심포니 오케스트라 등 음악계 거장들과 작업할 기회를 제공했다. 2016년 8월, 아지즈 쇼카키모프는 잘츠부르크 페스티벌에서 헤르베르트 폰 카라얀 젊은 지휘자상을 수상했다. 2년 후에는 바이올리니스트 파트리샤 코파친스카야와 함께 페스티벌 개막 콘서트를 지휘했다.
2017년부터 그는 터키의 텍펜 필하모닉 오케스트라의 예술 감독을 맡아왔다. 또한 여러 차례 국제적으로 유명한 오케스트라를 지휘했다. 2019년에는 쇼스타코비치를 주제로 한 프로그램에서 라디오 프랑스 필하모닉 오케스트라를 지휘하며 두각을 나타냈다. 2021년 6월에는 브람스와 드보르작을 주제로 한 프로그램에서 뮌헨 바이에른 방송 교향악단의 존 엘리엇 가디너 경을 긴급히 대체해 지휘했다. 앞으로 몇 시즌 동안 그는 비엔나 심포니 오케스트라, 스위스 로망드 오케스트라, 서울시립교향악단 등 여러 오케스트라를 지휘할 예정이다.
심포니 경력과 병행하여 아지즈 쇼카키모프는 서정 예술 분야에서도 활발히 활동해왔다. 2015년부터 2021년까지 독일 뒤셀도르프와 뒤스부르크의 도이체 오퍼 암 라인에서 카펠마이스터로 활동하며 나비부인, 살로메, 토스카, 스페이드 여왕 등 여러 작품의 오케스트라 피트에서 지휘봉을 잡았다.
이 비르투오소는 클라리넷 연주자 라파엘 세베르 및 베를린 도이체 심포니 오케스트라와 함께 베버를 주제로 한 아름다운 CD(Mirare, 2017)를 발표했다.
그가 스트라스부르 필하모닉 오케스트라와 처음 만난 것은 2014년 말러와 쇼스타코비치를 주제로 한 프로그램에서였다. 아지즈 쇼카키모프는 이 경험을 소중히 여기며 오케스트라 단원들이 “빛났다”고 회상하며 곧 “앙상블과 긴밀하고 우호적인 관계를 발전시켰다”고 말했다. 그는 오케스트라와 정기적으로 협력해왔으며 2020년 7월 음악 및 예술 감독으로 임명되었다. 2021년 9월부터 그 역할을 시작하며 2021|2022 시즌을 관객과 함께 나누기를 기대하고 있다.
