クープマンのソリスト、伴奏者、指揮者としての幅広く印象的な活動は、エラート、テルデック、ソニー、フィリップス、DGなどのレーベルで多数のLPやCDに録音されており、彼自身のレコードレーベル「アントワーヌ・マルシャンド」もチャレンジ・レコードによって配給されています。
45年以上にわたるキャリアの中で、トン・クープマンは五大陸の最も重要なコンサートホールやフェスティバルに出演してきました。オルガニストとしてはヨーロッパの最も権威ある歴史的楽器で演奏し、チェンバロ奏者およびアムステルダム・バロック・オーケストラ＆合唱団の指揮者としては、アムステルダムのコンセルトヘボウ、パリのシャンゼリゼ劇場、ミュンヘンのフィルハーモニー、フランクフルトのアルテ・オーパー、ニューヨークのリンカーンセンターとカーネギーホール、ウィーン、ロンドン、ベルリン、ブリュッセル、マドリード、ローマ、ザルツブルク、東京、大阪の主要なコンサートホールに定期的に出演しています。
1994年から2004年にかけて、トン・クープマンはヨハン・ゼバスティアン・バッハの現存するすべてのカンタータを指揮・録音するというユニークなプロジェクトに取り組みました。この大規模な事業により、彼はドイチェ・シャルプラッテン賞「エコー・クラシック」、BBC賞2008、エクトル・ベルリオーズ賞を受賞し、グラミー賞（米国）およびグラモフォン賞（英国）にノミネートされました。2000年にはユトレヒト大学からバッハのカンタータと受難曲に関する学術的業績に対して名誉学位を授与され、権威あるシルバー・フォノグラフ賞とVSCDクラシック音楽賞も受賞しました。2006年にはライプツィヒ市から「バッハ・メダル」を授与されました。
最近では、トン・クープマンはもう一つの主要なプロジェクトに着手しました。若きJ.S.バッハに大きな影響を与えたディートリヒ・ブクステフーデの全作品の録音です。この録音は2010年に30枚のCDリリースで完了する予定です。トン・クープマンは「国際ディートリヒ・ブクステフーデ協会」の会長を務めています。
トン・クープマンはゲスト指揮者としても非常に活発に活動しており、ヨーロッパ、アメリカ、日本の多くの著名なオーケストラと共演しています。オランダ放送室内管弦楽団の首席指揮者を務め、ロイヤル・コンセルトヘボウ・アムステルダム、ベルリン・ドイツ交響楽団、チューリッヒ・トーンハレ管弦楽団、ミュンヘン・バイエルン放送管弦楽団、ボストン交響楽団、シカゴ交響楽団、フランス放送フィルハーモニー管弦楽団、クリーブランド管弦楽団、ローマのサンタ・チェチーリア、ドイツ室内管弦楽団、ウィーン交響楽団と共演しています。次のシーズンにはニューヨーク・フィルハーモニック、ベルリン・ドイツ交響楽団、トリノのRAI管弦楽団、ストックホルム・フィルハーモニー管弦楽団、チューリッヒ・トーンハレ管弦楽団と新しいプログラムに取り組む予定です。2008年初頭のツアーの大成功を受けて、トン・クープマンは2011年から3年連続でクリーブランド管弦楽団のアーティスト・イン・レジデンスに任命されました。
トン・クープマンは定期的に出版活動を行っており、長年にわたりブレイトコップ＆ヘルテルのためにヘンデルのオルガン協奏曲全集の校訂に携わっています。最近ではカールス社からヘンデルの「メサイア」とブクステフーデの「Das Jüngeste Gericht」を出版しました。トン・クープマンはハーグ王立音楽院のチェンバロ科を指導し、ライデン大学の教授であり、ロンドン王立音楽アカデミーの名誉会員でもあります。
