ゲスト指揮者として、フランツ・ヴェルザー=メストはウィーン・フィルハーモニー管弦楽団と特に親密で生産的な芸術的パートナーシップを築いています。彼は同楽団の有名なニューイヤーコンサートに2011年と2013年の2回登壇し、ウィーンのムジークフェラインでの定期演奏会やヨーロッパ、日本、中国、アメリカでのツアーでも定期的に指揮をしています。ヴェルザー=メストとウィーン・フィルは、サラエボやヴェルサイユでの歴史的追悼コンサートでも共演しています。2023年のニューイヤーコンサートはヴェルザー=メストの指揮で3回目となります。
フランツ・ヴェルザー=メストはザルツブルク音楽祭の常連ゲストでもあり、オペラ指揮者として新たな解釈の基準を打ち立てています。最近の公演には、ルサルカ、ばらの騎士、フィデリオ、ダナエの愛、アリベルト・ライマンのオペラリア王、そしてリヒャルト・シュトラウスのサロメが含まれ、2018年には音楽祭の歴史に名を刻みました。2020年にはシュトラウスのエレクトラの初演100周年記念公演を指揮し、その期間中にルビーフェスティバルブローチを授与されました。ヴェルザー=メストは2021年にザルツブルクでエレクトラのさらなる公演を、2022年にはジャコモ・プッチーニの三部作を指揮しました。
フランツ・ヴェルザー=メストは数々の主要な栄誉と賞を受けています。彼はウィーン音楽愛好家協会の名誉会員であり、ウィーン・フィルの名誉リングの受賞者であり、アメリカ・ブルックナー協会のキレニー・メダルやケネディ・センター芸術金メダルも授与されています。2020年にはザルツブルク音楽祭のルビーピンを授与され、2021年にはザルツブルク音楽祭でのエレクトラの「最優秀音楽監督」部門でオーストリア音楽劇賞を受賞しました。
2020年夏の発売直後、フランツ・ヴェルザー=メストの最新著書Als ich die Stille fand. Ein Plädoyer gegen den Lärm der Weltはオーストリアでベストセラー1位となりました。2021年には英語版From Silence: Finding Calm in a Dissonant Worldが翻訳出版されました。
フランツ・ヴェルザー=メストは多数のCDおよびDVD録音を行っており、ザルツブルク音楽祭でのばらの騎士やサロメの録音も含まれています。多くの録音は国際的な賞を受賞しています。2022年夏には、ウィーン・フィルがザルツブルク音楽祭でのリヒャルト・シュトラウスのばらの騎士組曲とアルプス交響曲のライブ録音をスペシャル・アニュアル・エディションシリーズでリリースしました。