クレメンス・ハーゲンは、ベルリン・フィルハーモニー管弦楽団、ウィーン交響楽団、コンセルトヘボウ管弦楽団、カメラータ・アカデミカ・ザルツブルク、フライブルク放送交響楽団(SWR)、ドイツ・カンマーフィルハーモニー・ブレーメン、ヨーロッパ室内管弦楽団、NHK交響楽団、クリーヴランド管弦楽団など、多くの主要なオーケストラと共演してきました。クラウディオ・アバド、シルヴァン・カンブルラン、ダニエル・ハーディング、ニコラウス・アーンシュタイン、マンフレッド・ホーネック、インゴ・メッツマッハー、ホルスト・シュタイン、フランツ・ヴェルザー=メストなどの指揮者とも共演しています。
また、ヨーロッパ室内管弦楽団とニコラウス・アーンシュタイン、トーマス・ツェートマイアー、ピエール=ローラン・エマールと共にシューベルトの三重協奏曲をシュタイアマルテ・グラーツで演奏しました。このプロジェクトはワーナー・クラシックスからも制作されました。ヒューストン交響楽団とハンス・グラフと共にドイツをツアーしました。2006年にはクレーヴランド管弦楽団に戻る予定で、これらのコンサートはオスモ・ヴァンスカの指揮で行われます。
ソロ演奏やハーゲン四重奏団との多くのコンサートに加え、マルタ・アルゲリッチ、ルノー・カピュソン、イタマール・ゴラン、パウル・グルダ、エレーヌ・グリモー、ギドン・クレーメル、オレグ・マイゼンベルク、サー・アンドラーシュ・シフ、ベンジャミン・シュミット、内田光子と室内楽も演奏しています。
クレメンス・ハーゲンは、ハノーファーNDR放送フィルハーモニー管弦楽団と大植英次と共にウィーン、ブダペスト、ザグレブでツアーを行いました。さらに、ミハエラ・マルティンと今井信子と共にバッハのゴルトベルク変奏曲(シトコヴェツキー編曲)をアムステルダム、ロッテルダム、ハンブルク、ウィーンでトリオコンサートとして演奏しました。
2009年のウィーン国際フェスティバル(ウィーナー・フェストヴォーヘン)の開幕コンサートでは、ニコラウス・アーンシュタイン指揮のウィーン・フィルハーモニー管弦楽団と共にソリストとして招かれました。
録音作品には、パウル・グルダと共演したJVCレコードのベートーヴェンのチェロソナタ、ギドン・クレーメルとニコラウス・アーンシュタイン指揮のコンセルトヘボウ管弦楽団とのブラームスの二重協奏曲(テルデック)が含まれます。最近では、ダブリンガウス&グリムがベンジャミン・シュミットとクラウディウス・タンスキと共に録音したブラームスとプフィッツナーの室内楽のCDをリリースしました。